Organización del Colegio Mayor

El Colegio está fundado como una Fundación Benéfico-Docente, que lleva su mismo nombre. Desde 1997, el Patronato de la misma, está formado por los miembros del Consejo Social de la Universidad de Granada (con anterioridad lo fue la Junta de Gobierno, el antiguo Patronato universitario, la Corona española, etc.). El Consejo Social actúa en pleno y en comisiones (una de las cuales está referida a «Asuntos del Real Colegio Mayor de San Bartolomé y Santiago»). Actualmente es Presidente del Consejo Don Gregorio V. Jiménez López.

La Dirección está formada por el Rector del Colegio (Director), nombrado por el Rector de la Universidad de Granada, oída la Junta de Gobierno, a propuesta del Prelado de la Diócesis; por el Vicerrector (Subdirector) y por los Superiores (miembros del equipo de Dirección). También existe la figura del Capellán. Desde 1649, fecha de apertura del Colegio, fueron Rectores (el primero Don Tomás Crespo de Moya), 22 padres jesuitas hasta 1767 y, desde entonces, hasta la fecha, han existido otros 26 Rectores.

En el Colegio existe la Asamblea Colegial, formada por todos los Colegiales (y a la que asisten los miembros del personal que lo desean) y que constituye el órgano máximo de gobierno. Junto a ella, el Consejo Colegial, formado por siete Colegiales mayores y dos de primer año, elegidos todos por sufragio universal, y el Colegial Decano, también elegido por sus compañeros, de entre los Colegiales de último año, con Beca, que han presentado su candidatura.